Es una Unidad Administrativa Especial adscrita al Ministerio de la Protección Social (Decreto 205 de 2003), cuya evolución se dio a través de la Ley 36 de 1939 (Importación de drogas que forma habito pernicioso), el Decreto 257 de 1969 (Fondo Rotatorio de Estupefacientes FRE) y la Ley 30 de 1986 (Estatuto Nacional de Estupefacientes). El FRE se encarga a nivel regional de la vigilancia, seguimiento y control a las entidades públicas, privadas y personas naturales que distribuyan o usen medicamentos de control especial, tanto de uso humano como veterinario, así como garantizar la disponibilidad de medicamentos monopolio del Estado a través de la dispensación y distribución en su jurisdicción. Una de las funciones del FNE es llevar las estadísticas sobre importación, producción, distribución y consumo de medicamentos, materias primas, precursores y reactivos de control a nivel nacional.
